Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PI4K2AQ9BTU6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PI4K2AQ9BTU6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms