Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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C9orf85Q96MD7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf85Q96MD7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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