Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP2A3Q93084 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2A3Q93084 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms