Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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USP13Q92995 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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USP13Q92995 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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