Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TMIEQ8NEW7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMIEQ8NEW7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TMIEQ8NEW7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMIEQ8NEW7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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