Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHDC9Q8NEP7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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