Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RNF182Q8N6D2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms