Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms