Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HECW1Q76N89 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms