Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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