Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TDRD12Q587J7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms