Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNDC1Q4ZHG4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FNDC1Q4ZHG4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms