Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL40Q2TBA0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms