Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC96Q2M329 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms