Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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