Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms