Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CCDC6Q16204 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CCDC6Q16204 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CCDC6Q16204 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC6Q16204 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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