Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS72Q15906 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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VPS72Q15906 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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