Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VAMP3Q15836 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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