Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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