Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms