Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKP1Q13835 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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