Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LAMC2Q13753 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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