Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms