Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL1Q13616 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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CUL1Q13616 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CUL1Q13616 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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