Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HSPB3Q12988 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HSPB3Q12988 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms