Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms