Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBE1Q04446 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms