Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARID5AQ03989 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms