Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ID3Q02535 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms