Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
IFITM3Q01628 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IFITM3Q01628 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms