Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms