Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms