Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms