Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MANFP55145 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MANFP55145 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms