Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCA2P51531 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms