Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms