Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTGER3P43115 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTGER3P43115 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTGER3P43115 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTGER3P43115 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PTGER3P43115 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PTGER3P43115 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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