Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC1A1P43005 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms