Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNFSF9P41273 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNFSF9P41273 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms