Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD12P35452 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD12P35452 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms