Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECHS1P30084 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ECHS1P30084 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms