Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB8P17481 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms