Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAV1P15498 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAV1P15498 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms