Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC130P13994 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms