Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GLI3P10071 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms