Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms