Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms