Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF208O43345 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms