Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TO15178 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TO15178 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TO15178 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TO15178 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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